Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms