Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms