Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms