Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp2Q9EPK2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms