Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms