Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms