Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdf2Q9DCT5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms