Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr3Q9DCF9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr3Q9DCF9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms