Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms