Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hmg20aQ9DC33 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hmg20aQ9DC33 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hmg20aQ9DC33 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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