Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms