Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms