Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms