Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd9Q9D9M4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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