Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9H8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D9H8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms