Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms