Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot8Q9D8X5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms