Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms