Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rexo2Q9D8S4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms