Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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