Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms