Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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