Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chmp5Q9D7S9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp5Q9D7S9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp5Q9D7S9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp5Q9D7S9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp5Q9D7S9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp5Q9D7S9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms