Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa5Q9D7I0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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