Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps1Q9D7G0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms