Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ttc9bQ9D6E4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms