Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms