Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc81Q9D5W4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc81Q9D5W4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc81Q9D5W4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc81Q9D5W4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc81Q9D5W4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc81Q9D5W4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc81Q9D5W4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc81Q9D5W4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc81Q9D5W4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms