Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms