Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D5Q8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D5Q8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms