Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms