Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb1Q9D5L7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb1Q9D5L7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms