Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms