Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms