Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox2aQ9D4Y3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms