Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms