Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul2Q9D4H8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul2Q9D4H8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms