Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms