Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms