Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt20Q9D312 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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