Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms