Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms