Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Hddc3Q9D114 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Hddc3Q9D114 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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