Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms