Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms