Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mms19Q9D071 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mms19Q9D071 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Mms19Q9D071 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mms19Q9D071 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Mms19Q9D071 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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