Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain1Q9D035 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain1Q9D035 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms