Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm6Q9CZ69 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm6Q9CZ69 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms