Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsfl1cQ9CZ44 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms