Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms